Фамилия Мислишаев — редкая, и её разбор требует внимания к суффиксу и возможной основе. Словообразовательная модель указывает на тюркское или кавказское происхождение. Суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих) типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ или имен на -а, -я, но в данном случае он прикрепился к основе, которая сама по себе не является славянской.

Наиболее правдоподобная версия связывает фамилию с тюркским корнем «мыслы» (в разных диалектах — «задумчивый», «грустный», «мечтательный») или с арабским заимствованием «мысль» (мысль, идея), вошедшим в языки народов Кавказа и Поволжья. Тогда Мислиша — это прозвище человека, склонного к размышлениям, задумчивого, возможно, даже мрачного. Суффикс -ша в тюркских языках часто придаёт имени или прозвищу ласкательный или уменьшительный оттенок. Таким образом, «Мислиша» — это «задумчивый» или «маленький мыслитель». Затем к этой основе добавился русский патронимический суффикс -ев, который оформил фамилию по модели «сын Мислиши».

Вторая, менее вероятная версия, отталкивается от имени Мысыр (так у некоторых тюркских народов называли Египет) или от топонима Мислиш — названия населённого пункта. Однако ни одного реального села или города Мислиш в доступных источниках не зафиксировано, поэтому эта гипотеза остаётся умозрительной.

Географически фамилия Мислишаев встречается преимущественно на Северном Кавказе (Чечня, Ингушетия, Дагестан) и среди тюркоязычных народов (татары, кумыки). Это подтверждает её происхождение из среды, где тюркские языки или арабизмы через исламскую культуру были распространены, а затем фамилия была русифицирована при документальном оформлении в XIX—XX веках.

Социальный контекст: носители фамилии, скорее всего, были свободными общинниками или узденями (в горских обществах), а не крепостными, поскольку фамилии такого типа часто закреплялись за целыми родами, а не за отдельными крестьянами. Чёткого указания на сословие нет, но модель образования (прозвище + русский суффикс) типична для поздних фамилий, которые фиксировали при переписях или в метриках уже после присоединения Кавказа к Российской империи.

Фамилия Мислишаев — не массовая, её носители, скорее всего, принадлежат к одному или нескольким родственным родам. В отличие от распространённых фамилий на -ов, здесь интерес представляет именно тюркская основа с редким аффиксом -ша, что делает её заметной в ономастическом плане.