Фамилия Мислякина — женская форма фамилии Мислякин, и её разговорный, даже несколько простонародный облик сразу даёт подсказку: перед нами не аристократическая фамилия на -ский, а прозвищная, крестьянская или мещанская, образованная с помощью суффикса принадлежности -ин. Спор о происхождении основы, как это часто бывает, сводится к двум версиям, и обе имеют право на существование.

Первая и самая прямая версия связывает фамилию с древнерусским нецерковным именем Мисляка. В старину такие имена давали по внутренним качествам: Мисляка — от слова «мысль», то есть человек задумчивый, размышляющий, возможно, неспешный в решениях. Суффикс -яка придаёт имени фамильярный, уменьшительный оттенок, как в именах Верняка, Смеляка. В этом случае предок носителя фамилии был просто Мислякой, сына которого в документах записывали как «Мислякин сын».

Вторая версия, менее очевидная, опирается на диалектную лексику. В некоторых русских говорах, особенно на северо-западе и в Сибири, «мисляка» или «мисляк» могло означать нечто размякшее, кашеобразное, либо же — в переносном смысле — человека вялого, «размазню». Такое прозвище могли дать медлительному или болезненному человеку. Однако эта версия менее популярна у ономастов: именование по черте характера (задумчивость) встречается в русской антропонимии гораздо чаще, чем прозвище по физической «размяклости».

Географически фамилия Мислякины не принадлежит к числу широко распространённых. По данным современных исследований, её очаги чаще всего фиксируются в центральных областях России, в частности в бывших Владимирской и Костромской губерниях, а также на Урале. Это косвенно подтверждает её крестьянское происхождение: именно в этих регионах было сильно влияние северорусской ономастической традиции с её любовью к прозвищным фамилиям на -як/-яка. В дворянских родословных книгах фамилия не встречается, что окончательно снимает вопрос о её «благородном» происхождении.

Таким образом, Мислякина — это фамилия, которая буквально говорит о предке: «сын (или дочь) Мисляки». А сам Мисляка, скорее всего, был человеком, которого в деревне называли «думающим» или «задумчивым» — не от большого ума, а от привычки размышлять вслух или медлить с ответом.