Фамилия Мисцкиел — редкая и нестандартная для русского ономастикона. Её происхождение, скорее всего, не исконно русское, а прибалтийское или западнобалтийское. В пользу этого говорит характерный финальный суффикс «-ел», который встречается в литовских и латышских фамилиях (например, Стукялис, Катилис, Мацкелис и т.п.), а также в фамилиях польского происхождения, адаптированных на восточных окраинах Речи Посполитой.

Основа «Мисцк-» может восходить к литовскому слову «miskas» (лес) или к диалектному «miskelis» (лесовик, лесной человек). В таком случае фамилия могла быть прозвищем лесника, дровосека или человека, жившего в лесистой местности. Вторая, менее вероятная версия, связывает основу с древнепрусским «miski» (маленький, мелкий) — тогда прозвище могло указывать на невысокий рост или молодость предка.

На русской почве фамилия могла появиться в результате миграции литовских или польских крестьян в XIX веке, когда при переписях населения местные писцы русифицировали окончания. Однако суффикс «-ел» сохранился почти без изменений, что говорит о позднем закреплении фамилии в документах — вероятно, не раньше конца XIX века. Географически фамилия Мисцкиел тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи: современные Литва, Латвия, Беларусь, а также Калининградская область.

Словообразовательная модель фамилии не типична для русского языка: в ней нет привычных суффиксов -ов/-ев, -ин или -ский. Это указывает на то, что фамилия не прошла полную русификацию и осталась в форме, близкой к исходному прозвищу. Носители фамилии Мисцкиел — потомки людей, чья идентичность была связана с лесом, либо выходцев из балтийского региона, сохранивших в фамилии память о ландшафте или занятии предка.