Фамилия Мисунарова — женская форма, мужской вариант — Мисунаров. В основе, скорее всего, лежит тюркское мужское имя Мисунар. Разберём эту цепочку.

Имя Мисунар — составное. Первая часть восходит к арабскому «миср» или «маср» (Египет) либо к тюркскому «мыс» (рог, мыс). Вторая часть — «нар» (огонь, гранат, также «светоч» в переносном смысле) — часто встречается в восточных именах (например, Наргиз). Таким образом, Мисунар можно истолковать как «египетский огонь» или «мыс света», хотя точное значение теряется в глубине веков. Более прозаичная версия: имя могло быть образовано от прозвища человека, побывавшего в Египте или торговавшего с ним.

Суффикс -ов в фамилии Мисунаров — стандартный русский патронимический формант, указывающий на принадлежность («чей?» — Мисунаров, то есть сын Мисунара). Такие фамилии массово закреплялись за крещёными татарами, башкирами и другими народами Поволжья и Урала в XVI–XIX веках, когда они переходили в православие и получали фамилии по имени отца.

Географически фамилия редкая, встречается в основном среди татар и башкир, а также в смешанных русско-тюркских регионах — например, в Оренбургской, Челябинской областях и Башкортостане. Встречаются варианты написания с одной «с» — Мисунаров, что может указывать на местный говор или ошибки при записи в метриках.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Мисуров, Мисюра, Мисюрев) показывает, что корень «мисур» мог означать и «египтянин» (от старорусского «мисюрка» — шапка египетского типа, восточный шлем). Но в случае с Мисунаровым двойной суффикс («-ун-» + «-ар-») однозначно указывает на полное личное имя, а не на прозвище по головному убору. Предок Мисунаровых, скорее всего, носил имя Мисунар — редкое, но вполне реальное в тюрко-татарском именослове.