Фамилия Мисун звучит просто и по-украински тепло, и за этой простотой скрывается прозвище, а не крестильное имя. В основе фамилии лежит прозвище Миса, а суффикс -ун указывает на принадлежность: Мисун — это «сын Ми сы», «тот, кто из рода Ми сы». Такая словообразовательная модель с уменьшительными или «сыновьими» суффиксами типична для украинских и южнорусских фамилий, и именно она выдает региональное происхождение рода.

Что означало само прозвище Миса? По одной из версий, которую поддерживают многие исследователи, оно восходит к украинскому нарицательному «миса» — «большая тарелка», «миска». Прозвище могли дать человеку с хорошим аппетитом, тому, кто любил плотно поесть, или, наоборот, мастеру, который делал такую посуду. Впрочем, не исключено, что Миса — это местная, диалектная форма какого-либо христианского имени, например Михаил или Мирон, где основа сократилась до первого слога. Но версия с «тарелкой» выглядит правдоподобнее: в народе прозвища чаще цеплялись за внешние черты или привычки, чем за переделки канонических имен.

Позже прозвище Миса, изначально присоединенное к наследственному имени, полностью заменило его как в повседневной жизни, так и в официальных документах. Это обычная история для XVI–XVII веков, когда прозвища становились фамилиями и передавались детям без изменений. Так и получилось, что потомки человека, которого дразнили или уважительно называли Мисой, стали Мисунами.

Стоит добавить, что фамилия Мисун встречается преимущественно в западных и центральных областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев в России. Редкость фамилии — не повод для пустых догадок, а скорее указание на то, что род имел локальные корни и не разошелся широко по стране. Если искать аналоги, то рядом стоят фамилии Мисюра, Мисенко, Мисайло — все они образованы от той же основы, но с разными суффиксами, что показывает, насколько гибким было народное словообразование.