Фамилия Мисвахова — редкий случай, когда основа слова почти наверняка не славянская, а тюркская или арабская. В русском языке она выглядит как типичная фамилия на -ов/-ева, но суффикс здесь лишь грамматический оформитель, приклеенный к корню, который не склоняется по славянским моделям.

Скорее всего, в основе лежит имя или прозвище Мисвах. Это слово восходит к арабскому «мисвак» (مسواك) — так называется веточка дерева, которую на Востоке традиционно используют для чистки зубов. Исламская гигиеническая практика придаёт этому предмету почти ритуальный смысл: мисвак упоминается в хадисах как одобряемое пророком Мухаммедом действие. Имя Мисвах могло стать прозвищем человека, который делал или продавал эти палочки, либо же просто благочестивого мусульманина, строго следовавшего сунне. Встречаются и личные имена Мисвак / Мисвах у народов Северного Кавказа, Поволжья и Средней Азии — там они давались с надеждой на чистоту помыслов и веры.

Формант -ова указывает на принадлежность: «дочь / жена Мисваха» (женский род) или «из рода Мисваховых». Сама фамилия Мисвахов (а Мисвахова — её женская форма) могла оформиться в среде татар, башкир, кумыков или других тюркских народов, которые в XIX–XX веках активно русифицировали фамилии, добавляя русские патронимические суффиксы. Географически фамилия встречается в Татарстане, Башкортостане и у горских евреев, у которых тоже есть похожие по звучанию родовые имена.

Интересно, что в русском языке слово «мисвак» почти не известно, поэтому фамилия могла исказиться при записи в паспорт: вместо Мисвахова иногда пишут Мисвакова, Мисвахова или даже Мисвахова с двойным ударением. Правильное ударение, скорее всего, на втором слоге: Мисва́хова. Если ваши предки были выходцами с Кавказа или из Поволжья, они с высокой вероятностью были мусульманами, а фамилия хранит память о религиозном быте и чистоте.