Фамилия Мисявичуте — редкий случай, когда окончание сразу выдает пол носителя. Это литовская фамилия в женской форме. Мужской вариант звучал бы как Мисявичюс (лит. Misiavičius), а суффикс -уте (-utė) в литовском языке — типичный показатель дочери или незамужней женщины, уменьшительно-ласкательный. Другими словами, Мисявичуте — это «дочь Мисявичюса» или «маленькая Мисявичюте». В замужестве литовка сменила бы эту фамилию на форму с суффиксом -ене (-ienė), например Мисявичене, но исходная девичья фамилия остается в документах.

Основа фамилии — Мисявичюс — происходит от литовского личного имени или прозвища. Скорее всего, в его основе лежит корень «mis-», который может быть связан со словом «misti» (кормиться, питаться) или с диалектным «misius» (человек, который мешает, путает). Однако самая вероятная версия — это производное от старого литовского имени Misius, которое, в свою очередь, восходит к сокращенной форме от полных двухосновных имен вроде Misi-vydas или Misi-ginas. Вторая часть таких имен обычно означала «видящий» или «защищающий».

Географически фамилия Мисявичуте почти наверняка привязана к территории исторической Литвы, в первую очередь к Жемайтии или Аукштайтии. В России и Беларуси такие фамилии встречаются редко и, как правило, у потомков литовцев, переселившихся в XIX–XX веках. Интересно, что в польском языке эта фамилия могла бы писаться как Misiowicz, а в белорусской традиции — Мисявіч, что указывает на общие корни с фамилиями на -ович, но с литовским окончанием.

Социальный статус предков определить сложно. Литовские фамилии на -юс, -ис, -ас в массе своей принадлежали крестьянам и мелкой шляхте, но суффикс -вичюс (как в Мисявичюс) часто указывал на более позднее оформление фамилии, уже в XIX веке, когда литовцам массово давали фамилии по имени отца. Так что, скорее всего, предки Мисявичуте были обычными земледельцами или ремесленниками, никак не связанными с дворянством. Фамилия не имеет ничего общего с русскими Мисяевыми или Мисягиными — это чисто балтийская ономастическая модель, искать ее корни в славянских языках было бы ошибкой.