Фамилия Мизамидин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она образована от личного имени, причём не славянского, а восточного корня. Основа «Мизамид» или «Мизамидин» восходит к арабскому имени Мизамуддин (вариант — Мизамуддин), что переводится как «украшение веры» или «краса религии». В исламской ономастике такие имена с компонентом «-уддин» («аль-дин» — вера, религия) давали в знак благочестия. Прибавка «-ин» в русской фамилии — это не суффикс принадлежности (как в Иванов), а часть исходного имени, адаптированная при записи в документах.

Фамилия могла появиться у потомков человека, которого звали Мизамуддин. Носители такой фамилии — скорее всего, выходцы из регионов с сильным влиянием ислама и тюркских языков: Поволжье (татары, башкиры), Кавказ, Средняя Азия. В русской среде фамилия закрепилась через метрические книги или переписи, когда имя отца (Мизамуддин) записывали как фамилию сына — Мизамидин. Суффикс «-ов» или «-ев» в таком случае не добавили, потому что окончание «-ин» уже звучало как русский патронимический суффикс, и форма застыла без изменений.

Если смотреть на словообразовательную модель, фамилия Мизамидин — это «застывшее» отчество или дедичество. В русской традиции фамилии на «-ин» образуются от основ на «-а» или «-я» (Петя — Петин), но здесь основа на согласный, что нетипично. Это ещё одно подтверждение: фамилия не славянская, а перенесённая целиком из восточного именослова. Встречаются варианты написания — Мизамудинов, Мизамидинов, где уже добавили русский суффикс, но форма без суффикса — более старая и редкая.

В дореволюционных источниках фамилия почти не фиксируется, что говорит о её малой распространённости или позднем оформлении у крестьян и мещан из национальных окраин. Ономастические словари (например, работы А. Суперанской) упоминают подобные образования как примеры адаптации арабо-тюркских имён в русской среде. Социальный контекст: предки носителя фамилии могли быть муллами, торговцами или ремесленниками, но точных данных нет — фамилия слишком редка, чтобы строить статистику по сословиям.