Фамилия Мизикаев — редкий пример, в котором славянская модель словообразования накладывается на основу, явно не славянского происхождения. Суффикс -ев указывает на типичную русскую патронимическую форму: так образовывали фамилии от личных имён, прозвищ или профессий, отвечая на вопрос «чей?» — то есть сын Мизикая. Сама же основа Мизикай, скорее всего, восходит к тюркским или кавказским корням, что неудивительно для южных регионов России, где веками шло смешение народов.

Наиболее вероятная версия связывает прозвище Мизикай с тюркским словом «мизик» или «мизык» — так в некоторых диалектах называли кошку или котёнка. Прозвище могло достаться человеку за мягкий, ласковый нрав, ловкость или, напротив, за хитрость и независимость. В тюркских языках суффикс -ай часто образует ласкательные или уменьшительные формы, так что Мизикай — это буквально «котик» или «котёночек». В пользу этой версии говорит и то, что фамилии с корнем «миз-» встречаются у татар, башкир, а также у народов Северного Кавказа, например у кумыков.

Есть и другая гипотеза, менее распространённая: основа может быть связана с арабским именем Мизак (от «мисак» — договор, завет), которое попало в тюркскую среду через ислам. Но тогда форма Мизикай выглядит нехарактерной — обычно такие имена не получают уменьшительного тюркского суффикса. Поэтому версия с «кошкой» выглядит правдоподобнее.

Географически фамилия Мизикаев тяготеет к Северному Кавказу, особенно к Чечне, Ингушетии и Дагестану. В этих регионах она встречается у чеченцев и ингушей, хотя по происхождению корень может быть и тюркским — результат многовековых контактов с ногайцами, кумыками и другими степными народами. В русских переписях XIX века Мизикаевы почти не фиксируются, что подтверждает её позднее оформление и локальный характер.

Социальный статус первых носителей, скорее всего, был крестьянским или казачьим. Фамилии на -ев в этой среде часто давали по прозвищу отца, которое со временем закреплялось за всем родом. Мизикаевы не принадлежали к дворянству — в родословные книги эта фамилия не вписана, и в истории она осталась фамилией простых людей, чьё прозвище когда-то звучало тепло и по-домашнему.