Фамилия Мизрина образована от прозвища или нецерковного имени Мизра. В основе лежит диалектное слово «мизра» — так в ряде русских говоров называли человека маленького роста, невзрачного или щуплого. В словаре Владимира Даля зафиксировано слово «мизюра» в значении «плакса, разиня», а также «мизгать» — щуриться, глядеть сквозь прищур. Возможно, прозвище Мизра давали близорукому или подслеповатому человеку, который постоянно щурится.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Мизрина — дочь или жена Мизры. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от основ на -а, -я. Фамилия закрепилась в северных и центральных губерниях России. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне с прозвищем Мизра в Вятском и Пермском краях, что подтверждает северное происхождение фамилии.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с тюркским корнем «миср» — «Египет»: в старину египетские товары называли «мизрскими». Тогда Мизрой могли прозвать купца, торговавшего восточными тканями или пряностями. Однако эта гипотеза слабее: фамилия не встречается в южных регионах, где такое прозвище было бы уместнее, а её плотность сосредоточена именно на Русском Севере.

Фамилия редкая. В современной России больше всего носителей в Кировской и Нижегородской областях, что совпадает с историческим ареалом бытования вятских говоров. Мизрины — потомки свободных крестьян-землепашцев или ремесленников, получивших прозвище по внешней особенности.