Фамилия Мизрин образована от прозвища Мизря, а то, в свою очередь, — от глагола «мизюрить» (или «мизгать»). В северных и сибирских говорах это слово означало «щуриться», «смотреть прищурясь» или «глодать, обсасывать кости». Человек с таким прозвищем либо постоянно щурился (возможно, из-за близорукости или привычки), либо имел привычку неторопливо, дотошно обгладывать еду — характерная бытовая деталь, которая легко закреплялась в качестве уличного имени.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Мизрин буквально значит «сын Мизри» или «человек из семьи Мизри». Это типичная модель русских фамилий от прозвищ на -а/-я, которые не склонялись по падежам, как обычные имена. В документах XVII–XVIII веков такие формы фиксировали в крестьянской и посадской среде, особенно на Русском Севере и в Поволжье.

Есть и вторая, менее вероятная версия: основа могла восходить к тюркскому слову «миз» (медь, медный). В этом случае Мизря — человек, работавший с медью или торговавший ею. Но тюркская гипотеза слабее: окончание -ря в русских прозвищах редко образуется от тюркских основ, а глагол «мизюрить» в диалектах действительно существует и даёт прямую мотивацию.

Встречаемость фамилии крайне невысокая. Основной ареал — центральные области России и Поволжье. В дореволюционных списках Мизрины записаны в основном как государственные крестьяне и мещане. Известных исторических личностей с этой фамилией нет.