Фамилия Мизюнский — это классический пример фамилии, образованной по географическому принципу, причём с очень прозрачной и конкретной привязкой. Суффикс -ск- указывает на то, что её родоначальник происходил из населённого пункта с названием Мизюнь, Мизюны или Мизюнка. Такие фамилии (на -ский/-цкий) в основном носили дворяне, шляхта и духовенство, но позже они распространились и среди крестьян, особенно на западе Российской империи.

Корень «Мизюн-» — это, скорее всего, вариант прозвища Мизюн или Мизюк. В украинских и белорусских говорах «мизун» или «мизюн» — это ласкательное слово, означающее «баловень», «неженка», «любимчик». Так могли прозвать избалованного ребёнка или человека, привыкшего к комфорту. В польском языке есть близкое слово «mizun» с тем же значением. Таким образом, название села или хутора Мизюны могло произойти от прозвища первого поселенца, а фамилия Мизюнский — либо от этого села, либо напрямую от прозвища Мизюн, если человек был «из рода Мизюна».

География фамилии подтверждает западнорусское происхождение. Наибольшая концентрация носителей — в Беларуси (особенно в Гродненской и Брестской областях) и на западе Украины (Волынь, Житомирщина). Встречается она и в Польше, в приграничных с Беларусью воеводствах. В России фамилия редкая и, как правило, связана с миграцией из этих регионов.

Интересная деталь: в польской ономастике фамилия Miziński (близкий фонетический вариант) известна с XVI века и упоминается в шляхетских гербовниках. Однако Мизюнский — форма более простонародная, «русинская», указывающая на православное или униатское происхождение носителя. Если предок был шляхтичем, то, скорее всего, мелкой, осевшей на земле и со временем слившейся с крестьянством.

В написании фамилии возможны колебания: в дореволюционных документах встречается Мизюнскiй, а в польском варианте — Miziński. Ударение, судя по правилам восточнославянской акцентологии, падает на второй слог: Мизю́нский.