Фамилия Мохнашина — женская форма фамилии Мохнашин. Её основа — прозвище Мохнаша. В русских говорах «мохначом» или «мохнатой» называли человека с густыми, торчащими волосами, лохматого, косматого. Суффикс -аш- в прозвище Мохнаша — характерный для русской народной антропонимии экспрессивный элемент, который придаёт слову разговорный, даже слегка пренебрежительный оттенок. Такие прозвища (ср. Грязнуша, Рвача, Кудряш) нередко закреплялись за носителем как постоянное именование.

Фамилия образована по стандартной модели: к основе Мохнаш- прибавлен патронимический суффикс -ин, означающий «чей?» — то есть сын или потомок Мохнаши. Окончание -а указывает на женскую линию: речь идёт о женщине из рода Мохнашиных. В официальных документах XIX века такие фамилии часто фиксировали именно в женском роде (например, «вдова Мохнашина»), хотя в современном употреблении мужская форма — Мохнашин.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России. Встречается в архивных записях Вологодской, Архангельской, Костромской губерний — там, где говоры сохраняли слово «мохнач» в значении «леший» или «чёрт» (по созвучию с мхом, лесной нечистью). Однако основное, бытовое значение прозвища — просто лохматый человек, без мистического подтекста. Второй, менее вероятный вариант: от диалектного «мохнашка» — вид варежки или рукавицы из шерсти, но тогда прозвище получил бы рукавичник или торговец, что встречается реже.

Редкость фамилии объясняется тем, что основа Мохнаша — неканоническое, обиходное имя, которое в крестьянской среде давали по внешнему признаку. После отмены крепостного права такие прозвища часто заменяли на более благозвучные или переделывали в фамилии с суффиксом -ов (Мохначёв). Мохнашины — одна из немногих ветвей, сохранивших исходную форму на -ин, что указывает на давнюю, возможно, ещё допетровскую фиксацию в писцовых книгах.