Фамилия Мокоида — редкая и нестандартная для русского слуха. Её происхождение, скорее всего, не славянское, а японское, и в этом её главная особенность.

В японском языке фамилия Мокоида (もこいだ, 茂小井田 или другие варианты иероглифов) состоит из двух частей: «Моко» и суффикса «-ида». Суффикс «-ида» (田) означает «рисовое поле» и чрезвычайно распространён в японских фамилиях, указывая на связь с землёй или местом жительства. Первая часть «Моко» может быть записана разными иероглифами, например, «茂» (густой, пышный) или «小» (маленький) в сочетании с «子» (ребёнок), но точное значение зависит от конкретной иероглифической записи, которая не всегда однозначно восстанавливается. Таким образом, Мокоида — это типичная японская топонимическая фамилия, означающая «рисовое поле Моко» или «поле семьи Моко».

Если же рассматривать фамилию в русском контексте, она могла появиться как русификация японской фамилии у потомков смешанных браков или у людей, чьи предки были выходцами с Дальнего Востока. Встретить её в исторических документах по центральной России практически невозможно — это не крестьянская фамилия на -ов или -ин и не дворянская на -ский. В современной России носители фамилии Мокоида — это, как правило, либо люди с японскими корнями, либо единичные случаи, когда фамилия была изменена или дана искусственно (например, в советское время при смене документов).

Версия о славянском происхождении маловероятна: в русском языке нет корня «мок-», который бы в сочетании с суффиксом «-оида» давал осмысленное прозвище или имя. Суффикс «-оида» нехарактерен для русской ономастики — он встречается в греческих заимствованиях (например, «параболоид»), но не в фамилиях. Поэтому основная и единственная правдоподобная гипотеза — японское происхождение с привязкой к конкретной местности или роду.