Фамилия Молдагуиарова — редкий случай, когда географическое происхождение почти полностью проясняет её устройство. Корень здесь — «Молдагуиар», что явно указывает на казахское или тюркское имя или прозвище. Суффикс «-ова» — стандартный русский патронимический формант, который присоединяли к фамилиям при русификации в документах, чаще всего в XIX–XX веках. Таким образом, перед нами женская форма фамилии; мужской вариант — Молдагуиаров.

Само имя «Молдагуиар» состоит из двух частей: «молда» (от арабского «мулла» — учёный, грамотный, религиозный наставник) и «гуиар» (возможный вариант от «гүйар» или «гуяр» — в тюркских языках может означать «петь», «звучать», либо быть искажённым «куар» — «защитник», «страж»). Наиболее правдоподобная версия: «Молдагуиар» — это составное имя-пожелание, вроде «учёный-защитник» или «поющий мулла». В казахской антропонимике такие двухосновные имена встречаются часто, хотя конкретная форма «Молдагуиар» не входит в число самых распространённых.

Географически фамилия почти наверняка привязана к регионам с компактным проживанием казахов — это Западный Казахстан (Актюбинская, Западно-Казахстанская области) или приграничные районы России (Астраханская, Оренбургская области). Там в советское время активно проводилась паспортизация, и тюркские имена получали русские окончания. Носительница фамилии с окончанием «-ова» — это, скорее всего, женщина, чей предок по мужской линии носил имя Молдагуиар или прозвище, данное за учёность или религиозную деятельность.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на «-улы» или «-кызы», которые сохранились в казахской среде, форма на «-ов/ -ова» — маркер того, что семья прошла через советскую бюрократию и, вероятно, давно живёт в смешанной или русскоязычной среде. Фамилия очень редкая — в открытых базах данных встречаются единичные записи, что делает её практически уникальной. Предки носителей могли быть аульными муллами, учителями при мечети или просто уважаемыми грамотеями в степи.