Фамилия Молдрахманова — редкий случай, когда в одной основе соединились два разных языка: тюркский и арабский. Первая часть, «молд», восходит к тюркскому слову «молда» (варианты — «молдо», «мулла»). Так называли мусульманского священнослужителя, грамотея, учителя при мечети. Вторая часть, «рахман», — арабская: от имени Рахман (Ar-Rahman — «Милостивый», один из эпитетов Аллаха). Получается, что Молдрахманова — это буквально «дочь (или жена) Молды по имени Рахман». Однако фамилия образована не от женского, а от мужского имени-прозвища Молдрахман, которое могло означать «мулла по имени Рахман» или «милостивый мулла».

Суффикс «-ов(а)» указывает на русскую модель образования фамилий: в XIX–XX веках, когда у народов Средней Азии и Поволжья стали массово фиксировать фамилии, к именам и прозвищам часто добавляли этот суффикс по образцу русских дворянских и крестьянских родов. Так фамилия Молдрахманова закрепилась в документах, хотя исходное тюркское прозвище не требовало такого окончания.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где ислам и тюркские языки были распространены исторически: Татарстан, Башкортостан, Казахстан, Узбекистан. Встречаемость крайне низкая — в базах данных переписей и телефонных справочников Молдрахмановых единицы. Это не случайно: сложное арабо-тюркское сочетание в фамилиях — редкость, обычно их упрощали до Молдаев, Рахманов или Муллаев.

Предки носительницы фамилии, скорее всего, были связаны с религиозной или образовательной средой: муллы, учителя медресе, переписчики книг. Сама фамилия — не прозвище по ремеслу, а именование по отцу: «чей сын?» — «Молдрахмана», то есть потомок человека, которого звали Молдрахман. В русском быту фамилия склоняется по правилам женского рода: нет Молдрахмановой, дать Молдрахмановой. Мужской вариант — Молдрахманов.