Фамилия Молодзон — редкий случай, когда основа читается почти прозрачно, а суффикс ставит в тупик. Корень «молод-» сразу отсылает к прилагательному «молодой». Однако типичные русские фамилии от этого слова — Молодцов, Молодых, Молодкин. Формант «-зон» для них нехарактерен. Здесь мы имеем дело не с исконно русской моделью, а с влиянием немецкого или идишского суффикса «-зон» (от нем. Sohn — «сын»). Такие фамилии возникали в среде еврейского населения Российской империи, особенно в черте оседлости, где при оформлении документов в XIX веке к прозвищу или имени отца добавляли немецкий или польский суффикс. «Молодзон» — это «сын Молодого» или «сын того, кого звали Молодым».

Скорее всего, прозвище «Молодой» дали не по возрасту, а по характеру или социальному статусу — например, младшему в роду, или человеку, который долго сохранял бодрость и юношескую внешность. В еврейской среде такие прозвища нередко закреплялись как фамильные, а при переходе на русский язык или при записи в метрические книги «Молод» легко превращалось в «Молодзон» по аналогии с фамилиями вроде Абрамзон, Берзон.

Географически фамилия тяготеет к западным губерниям: Волынской, Подольской, Киевской, а также к Царству Польскому. Встречается она и у потомков эмигрантов в Израиле, США и Германии. В дореволюционных списках фамилия почти не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении — вероятно, уже во второй половине XIX века.

Интересная деталь: ударение в фамилии может падать как на последний слог (Молодзо́н), так и на первый (Мо́лодзон) — это зависит от местной традиции. Второй вариант встречается реже и может указывать на то, что носители произносят её как «Молод-зон», подчёркивая корень, а не суффикс.