Фамилия Мотиюнас, предположительно, представляет собой фонетический вариант фамилии Матеюнас. В свою очередь, фамилия Матеюнас образована от прозвища Матеюн. Оно берет начало от литовского глагола mateune, что в переводе на русский язык означает «мерить, измерять». Вероятно, именование Матеюн относится к так профессиональным и указывает на род деятельности его обладателя. Так могли назвать того, кто занимался торговлей или пошивом одежды.