Фамилия Мотеюнас — литовского происхождения, что сразу видно по суффиксу -ас, типичному для литовских фамилий мужского рода. В русской среде этот суффикс часто русифицируют, но исходная форма звучит как Motiejūnas или Motiejunas. Основа фамилии — личное имя Motiejus, литовский аналог русского Матвей, которое, в свою очередь, восходит к древнееврейскому Маттитьяху — «дар Яхве» (Божий дар). Таким образом, Мотеюнас означает буквально «сын Мотеюса» или «потомок Мотеюса», то есть образовано по отчеству.

В Литве фамилии с суффиксом -ūnas (-юнас) относятся к патронимическому типу, широко распространённому в северной и восточной частях страны. Они указывали на принадлежность к роду или семье, часто закрепляясь за крестьянскими династиями в XIX веке, когда литовцам официально присваивали фамилии. Носитель фамилии Мотеюнас — скорее всего, потомок человека по имени Мотеюс, который мог быть крестьянином или ремесленником в одной из деревень Жемайтии или Аукштайтии.

В русском контексте фамилия встречается редко и обычно сохраняет ударение на последний слог — Мотеюна́с. Варианты написания в документах могут колебаться: от Мотеюнас до Матеюнас, в зависимости от транслитерации. При этом в самой Литве фамилия не считается редкой — в базах данных населения она встречается у нескольких сотен человек, преимущественно в Каунасском и Паневежском уездах.

Если сравнивать с однокоренными русскими фамилиями, то Мотеюнас — это литовский аналог Матвеева. Но в отличие от русского варианта, где суффикс -ев просто указывает на принадлежность, литовская модель с -юнас подчёркивает именно сыновью связь, что характерно для балтийской ономастики. Встречаются также формы Мотеюс, Мотеюсене (женская), но Мотеюнас — самая устойчивая мужская версия.