Фамилия Моцкобили — одна из тех, что сразу выдают грузинское происхождение. Характерный суффикс -или (в русской записи часто -или, -ишвили, -дзе) указывает на принадлежность к определённому роду или месту. В данном случае основа «Моцкоб» почти наверняка связана с грузинским словом «моцкоба» — «пост», «воздержание», а в более широком смысле — «постник», «аскет». Таким образом, фамилия могла образоваться от прозвища Моцкоби — человека, строго соблюдавшего церковные посты, возможно, монаха или глубоко верующего мирянина.

Модель образования типична для восточной Грузии, особенно для регионов Кахетии и Картли, где фамилии на -или распространены повсеместно. Если бы фамилия звучала как Моцкобидзе, это указывало бы на западногрузинские корни (Имеретия, Гурия), но -или выдаёт восточную локализацию. В русских документах фамилию могли записывать с окончанием -ев или -ов, но Моцкобили сохранила исходную грузинскую форму, что говорит о сравнительно поздней фиксации или о том, что носители не стремились адаптировать её под славянские шаблоны.

Интересно, что фамилия редкая и не встречается в массовых списках грузинских дворянских родов. Скорее всего, её носители — выходцы из крестьянской или духовной среды. Прозвище «постник» могло закрепиться за предком, который выделялся благочестием, или за тем, кто жил при церкви. Встречаются и другие версии: некоторые исследователи связывают «моцкоба» с названием местности, но географических объектов с таким корнем в Грузии почти нет, поэтому версия с прозвищем выглядит убедительнее.

С точки зрения словообразования, суффикс -или в грузинском языке выполняет ту же роль, что русский -ов: он указывает на происхождение от кого-то. Моцкобили буквально означает «принадлежащий Моцкоби», «из рода Моцкоби». Это типичная патронимическая модель, но с ярко выраженным религиозным оттенком основы. В современной Грузии фамилия встречается редко, в основном в восточных районах, и почти не известна за пределами страны.