Фамилия Мойтапов — редкий случай, когда основа не татарская и не калмыцкая, как можно было бы подумать, а монгольская, причём с почти прозрачной внутренней формой. Если разбить фамилию на части, сразу видно: Мойтап-ов. Суффикс -ов указывает на русскую модель патронимического образования — «чей?» — то есть сын или потомок человека по прозвищу Мойтап. А вот само прозвище Мойтап — это русифицированная запись монгольского слова «мойтав» или «мойтап», которое в разных диалектах означает «подарок», «дар» или «преподношение». В монгольских языках (халха-монгольском, бурятском, калмыцком) слово «мойтаг» или «мойтах» имеет значение «дар», «подарок», часто в контексте подношения старшему или почётному лицу. Таким образом, Мойтап — это, скорее всего, не имя, а прозвище, данное человеку, которого воспринимали как «дар» или «подарок» — возможно, долгожданного ребёнка, или же того, кто родился в праздник, или был приёмным.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически жили монгольские народы, — Бурятия, Калмыкия, Забайкалье, а также к местам расселения казаков, которые нередко вступали в браки с бурятками и калмычками. Встречается фамилия и у сибирских старообрядцев, что может говорить о заимствовании прозвища от местного населения. Важно, что ударение в фамилии, судя по аналогиям (Мойта́пов), падает на второй слог, что характерно для многих фамилий на -ов с короткой основой.

Словообразовательная модель проста: к основе Мойтап- добавлен русский патронимический суффикс -ов. Это типичная картина для фамилий нерусского происхождения, которые были адаптированы в русской среде в XVII–XIX веках. Интересно, что в самой монгольской традиции фамилий в современном понимании не было — использовали родовые имена или прозвища, а при записи в метрики или ревизские сказки русские чиновники оформляли их по своему шаблону: «Мойтапов» = «сын Мойтапа».

Спорных версий практически нет: альтернативная гипотеза о тюркском корне (например, от «мойта» — «смешной», «забавный» в некоторых тюркских языках) маловероятна, так как для тюркских фамилий характерны другие суффиксы (-лы, -лык) и иная фонетика. Монгольская версия и по смыслу, и по звучанию убедительнее. Так что носитель фамилии Мойтапов с высокой вероятностью ведёт род от монголоязычного предка, которого в своё время назвали «даром» — возможно, с надеждой или благодарностью.