Фамилия Мозонен — редкий пример, где географический корень почти очевиден, а способ образования требует пояснения. Основа фамилии — «Мозон» — скорее всего, происходит от названия финского или карельского топонима. В Финляндии есть несколько мест с названием Mözonen или Mösonen, а также озеро Мозонъярви (сегодня на территории Карелии). В таком случае фамилия Мозонен — типичный для прибалтийско-финской ономастики патроним на -нен, означающий «из рода того, кто связан с Мозоном» или «житель местности Мозон». Формант -нен в карельских и финских фамилиях выполняет ту же роль, что русский суффикс -ов/-ев: указывает на принадлежность.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным русским словом «мозонь» (северные говоры, от «мозжить» — ныть, болеть). Тогда прозвище Мозон могли дать человеку медлительному или болезненному. Однако для фамилии на -нен такое объяснение натянуто: в русской среде подобные прозвища обычно получали суффиксы -ов/-ин, а не финский -нен. Фамилия почти наверняка оформилась на территории, где смешивались русское и карельское население — в Заонежье, Олонецком крае или на юге Карелии.

С точки зрения словообразования, Мозонен — «чистая» финская модель: основа + суффикс -nen. В русском языке фамилию не склоняли по падежам, как и другие фамилии на -нен (Сойнинен, Хаккинен). Носители фамилии в основном встречаются на северо-западе России, а также в Финляндии, где фамилия могла писаться как Mözonen. В XIX веке, при русификации финских фамилий, букву «ö» могли заменять на «о», что дало современное написание.

Сословно фамилия не элитарная: её обладатели — скорее всего, крестьяне-карелы или обрусевшие финны, жившие на границе двух культур. Никаких известных дворянских родов или громких исторических фигур с такой фамилией нет, что только подтверждает её народное происхождение.