Фамилия Мубиев — редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. Её основа, корень «муб-», не встречается в списке распространённых русских имён или прозвищ, что заставляет искать объяснение за пределами славянской ономастики. Скорее всего, перед нами фамилия, принесённая на русскую почву из тюркских или кавказских языков.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию Мубиев с арабским именем Муби (или Мубий), которое в исламской традиции может означать «дающий жизнь» или «оживляющий». Это одно из имён-эпитетов, восходящих к божественным атрибутам. В тюркских языках, особенно у народов Северного Кавказа (чеченцев, ингушей, кумыков), такие имена нередко становились основой для фамилий, оформляясь русским суффиксом -ев. Таким образом, Мубиев — это «сын Муби» или «потомок Муби».

Географически фамилия тяготеет к Северному Кавказу и Поволжью. Встречается у чеченцев (тейп Мубиевых известен в некоторых горных обществах), а также у татар и башкир. В среде русского крестьянства эта фамилия практически не фиксируется — её нет в старых переписных книгах центральных губерний, что подтверждает её иноязычное, преимущественно мусульманское происхождение.

Словообразовательная модель проста: к основе «Муби» добавлен патронимический суффикс -ев, который в русском языке присоединяется к основам на мягкий согласный или гласный. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образуются от твёрдых основ, -ев указывает на мягкость или иноязычный характер исходного слова. Ударение, скорее всего, падает на первый слог — Му́биев, хотя в разговорной речи допустим и вариант с ударением на второй.

Вторая, менее убедительная версия, выводит фамилию от прозвища «Муба» — в некоторых говорах так могли называть молчаливого или угрюмого человека. Однако эта гипотеза слабая: слово «муба» не зафиксировано в диалектных словарях как самостоятельное прозвище, и объяснение через арабское имя выглядит куда надёжнее.