Фамилия Муфтандинов — один из тех редких случаев, когда корень слова почти наверняка указывает на конкретную профессию или социальный статус предка, но не в русской, а в тюркской среде. Основа фамилии — «муфтандин» — восходит к слову «муфтий» (араб. muftī — «выносящий решение, судья по шариату») с характерным тюркским суффиксом принадлежности -ан/-анды. В буквальном смысле «муфтандин» означает «относящийся к муфтию», «принадлежащий муфтию» или «человек из окружения муфтия». Это могло быть прозвище для служителя при муфтии, ученика или даже для самого муфтия, но с уменьшительно-притяжательным оттенком.

Фамилии с таким суффиксом (-андин/-анды) встречаются в основном у татар и башкир, где они часто указывают на происхождение от конкретного лица или рода. Форма Муфтандинов, с русским патронимическим суффиксом -ов, говорит о том, что фамилия окончательно оформилась уже в русской административной среде: носителя записали в метрику или ревизскую сказку как «Муфтандин сын», а затем закрепили фамилию по отцу. Интересно, что в тюркских языках есть и параллельная форма — Муфтандинов может быть вариантом фамилии Муфтахов или Муфталиев, где корень тот же, но словообразовательная модель другая.

Сословно носители фамилии, скорее всего, были из числа служилых татар, мулл или их детей. В XVIII–XIX веках многие татарские духовные лица и их потомки получали фамилии именно по должности отца или деда. Муфтандинов — не массовая фамилия, она редкая и компактно локализована в Поволжье, особенно в Татарстане и Башкортостане. Встречаются также единичные записи в Оренбургской области и в Средней Азии, что связано с переселениями татар в XIX — начале XX века.

Поскольку фамилия образована от арабского слова через тюркское посредничество, она — яркий пример того, как исламская духовная культура отразилась в русском фамильном ономастиконе.