Фамилия Мукамадиев — одна из тех, что сразу выдают тюркские корни, а точнее — татарское или башкирское происхождение. Её основа — арабское имя Мухаммад (в татарском произношении — Мөхәммәт, Мухаммат или Мукамат), что значит «восхваляемый», «прославленный». Это имя самого почитаемого пророка в исламе, и его производные встречаются у многих народов, принявших ислам, от Поволжья до Кавказа.

Разберём словообразовательную модель. Фамилия образована по русскому патронимическому шаблону: к основе «Мукамади» (вариант имени Мухаммад с диалектным смягчением или оглушением) прибавлен суффикс «-ев». В русской традиции суффикс «-ев» присоединяли к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или «й». Здесь он заменил татарский патронимический формант «-улы/-кызы» (сын/дочь). Таким образом, Мукамадиев буквально означает «сын Мукамади», то есть потомок человека по имени Мукамат или Мухаммат.

В татарской среде фамилии на «-ев» массово закрепились после реформ XVIII–XIX веков, когда началась обязательная паспортизация. До этого человека чаще называли по имени отца с добавлением «улы»: скажем, Мукамат улы. При записи в метрические книги русские чиновники оформляли такие имена по привычной модели, отсюда и «-ев». Вариант «Мукамадиев» менее распространён, чем «Мухамадиев» или «Мухаметдинов», но он устойчиво встречается у татар и башкир западных и центральных районов Башкортостана, а также в Оренбургской области и Татарстане.

Редкость фамилии в том, что в основе лежит не стандартная форма «Мухаммад», а её диалектный вариант с оглушением «х» до «к» и сжатием — «Мукамат» или «Мукамади». Такие фонетические сдвиги характерны для мишарского диалекта татарского языка и некоторых говоров башкирского. Поэтому предки носителя фамилии, скорее всего, происходили из среды служилых татар или башкир, которые в XVI–XVII веках несли сторожевую службу на юго-восточных рубежах России, а позже осели в деревнях. Прямых указаний на сословие нет, но среди татарских фамилий этого типа много и крестьянских, и купеческих.