Фамилия Мухамбекова образована по самой распространённой в русской ономастике модели — с помощью патронимического суффикса -ов, который указывает на принадлежность («чей?»). Конечное -а — это женский вариант фамилии; мужская форма — Мухамбеков. Основа здесь сложная, двухкорневая: она восходит к тюркскому (скорее всего, казахскому) мужскому имени Мухамбек.

Имя Мухамбек, в свою очередь, состоит из двух частей: «Мухам» (сокращение от Мухаммед — имя пророка, араб. «восхваляемый») и «бек» (тюрк. «господин», «князь», «правитель»). Таким образом, имя Мухамбек означает «господин Мухаммед» или «князь, связанный с Мухаммедом». Это типичная для тюрко-мусульманских народов именная конструкция, где к сакральному или уважаемому имени добавляется титул, подчёркивающий знатность или почёт.

С точки зрения географии фамилия Мухамбекова — явный маркер казахского происхождения. В Казахстане имя Мухамбек и его варианты (Мухамбет, Махамбет) хорошо известны, особенно в западных и южных регионах. Русский суффикс -ов фамилия получила в период делопроизводства Российской империи, когда тюркские имена и прозвища массово русифицировали для записи в метрики и ревизские сказки. Так что предки носителей фамилии, скорее всего, были казахами, получившими фамилию по имени отца или деда, которого звали Мухамбек.

Важно различать эту фамилию с похожей, но другой по смыслу — Мухаметбекова. В последней корень «Мухамет» — это полная форма имени Мухаммед, а «бек» — тот же титул. Сокращение «Мухам» в имени Мухамбек — это не ошибка, а диалектная или разговорная форма, характерная для казахского языка, где конечные согласные часто выпадают или редуцируются.

Таким образом, фамилия Мухамбекова — яркий пример того, как арабское религиозное имя, тюркский титул и русский патронимический суффикс слились в одну фамилию, рассказывающую о происхождении её носителей из казахской среды и о том, что в роду был человек, носивший имя-титул «господин Мухаммед».