Фамилия Мухайдаров — тюркская по происхождению, и её разумнее всего разбирать с корня. В основе лежит арабское имя Мухайдар (вариант Мухайдир), которое восходит к корню «ха-да-ра» — «присутствовать», «зеленеть». В мусульманской ономастике это имя связывают с эпитетом «зелёный», что в переносном смысле означало «цветущий», «благодатный» или «тот, кто приносит процветание». Имя Мухайдар — это уменьшительная форма от более известного Ахдар, и в арабской традиции оно нередко ассоциировалось с пророком Мухаммедом.

Модель образования фамилии типична для татарской и башкирской среды: к основе Мухайдар добавили русский патронимический суффикс -ов, который в тюркских фамилиях Поволжья и Урала стал стандартным маркером фамилии. Буква «а» перед суффиксом — это «а» из арабской огласовки, которую в русской записи не стали редуцировать. Таким образом, фамилия буквально означает «потомок Мухайдара», то есть сын или внук человека, носившего это имя.

Географически фамилия Мухайдаров наиболее распространена в Татарстане и Башкортостане, а также среди татарских диаспор в Челябинской, Оренбургской областях. Встречается она и у казахов, но там чаще пишется как Мухайдаров или Мухайдиров, с сохранением более близкой к арабскому произношению формы. В русских переписях XVII–XIX веков эта фамилия не фиксируется — она оформилась в основном после отмены крепостного права, когда у тюркских народов начали массово записывать фамилии по отцу.

Есть и менее очевидная версия: некоторые исследователи связывают основу не с арабским «зелёный», а с тюркским «мухай» (от «мухаййа» — «красивый», «изящный»). Но эта гипотеза слабая: арабское заимствование в исламской культуре Поволжья было основным источником имён, и тюркская параллель — скорее случайное созвучие.

В дореволюционных метрических книгах фамилия могла писаться через «и» — Мухайдиров, что ближе к арабской огласовке, но в советских документах закрепился вариант с «а». Если вы встретите у кого-то фамилию Мухайдаров с ударением на последний слог — это региональная особенность татарского произношения, где ударение часто падает на конец слова.