Фамилия Мухайдарова — яркий пример того, как тюркское имя, пройдя через русскую модель фамилии, закрепилось в документах. Основа здесь — мужское имя Мухайдар, а суффикс -ов/-ев (в женском роде -а) указывает на стандартный способ образования русских фамилий: «чей?» — Мухайдаров, то есть потомок Мухайдара.

Имя Мухайдар — арабского происхождения, восходит к слову «мухайдар», что означает «зеленеющий», «цветущий», «благоденствующий». В исламской культуре зелёный цвет символизирует рай, жизнь и достаток, поэтому имя несли в себе пожелание благополучия. Встречается оно у многих тюркских народов: татар, башкир, казахов. Фамилия Мухайдарова особенно распространена в среде татар и башкир, а географически чаще всего фиксируется в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях.

Словообразовательная модель проста: к основе Мухайдар прибавили патронимический суффикс -ов, характерный для русских фамилий, которые давали нерусскому населению при переписях и крещении. Именно так в XVII–XIX веках фиксировали фамилии по отцу: если отца звали Мухайдар, его дети становились Мухайдаровыми. Женская форма Мухайдарова — это та же фамилия в грамматическом женском роде, обычная для дочерей и жён.

Интересная деталь: в некоторых говорах имя могло произноситься с ударением на последний слог — Мухайда́р, но в фамилии ударение чаще всего смещается на третий слог: Мухайда́рова, хотя встречаются и варианты с ударением на первый слог у носителей. Разброс ударений — обычное дело для фамилий, заимствованных из восточных языков и адаптированных русской грамматикой.

В социальном плане предки-носители этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами из тюркоязычной среды, нередко — из служилых татар, которые после присоединения Казанского и других ханств переходили на русскую службу. Фамилия не указывает на дворянское происхождение, но и не говорит о низком статусе: в Поволжье и Приуралье татарские и башкирские фамилии на -ов встречаются у всех сословий.