Фамилия Мухтахутдинов — редкий пример, когда в основе лежит не просто арабское имя, а сложносоставное теофорное (содержащее имя Бога) образование. Корень здесь — мужское личное имя Мухтахутдин, которое переводят как «избранный для веры» или «избранный религии». Первая часть, «мухта», восходит к арабскому «мухтар» — «избранный», вторая — «хут» — искажённое или стяжённое «уддин» («ад-дин»), то есть «вера», «религия». Полное имя звучало бы как Мухтар-ад-Дин, но в тюркской языковой среде, где фамилия и сложилась, оно подверглось фонетическому упрощению.

Суффикс «-ов» указывает на типичную для русской традиции модель патронимической фамилии: «чей?» — «сын Мухтахутдина». Вероятнее всего, фамилия сформировалась в среде поволжских татар или башкир, где имена арабо-персидского происхождения были распространены, а русификация фамилий прошла через добавление суффикса при записи в метрики или переписи. Носители такой фамилии — потомки человека, которого в общине выделяли как «избранного» в делах веры, возможно, религиозного учителя, муллы или просто благочестивого старца, получившего такое имя при рождении.

Обратите внимание на редкость корня: в отличие от массовых фамилий вроде Мухаметдиновых, где основа — имя пророка, здесь использован эпитет «избранный». Это делает фамилию более индивидуальной и менее распространённой. Географически она чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане и среди татарской диаспоры в других регионах России. Сословно носители могли относиться к духовенству или крестьянству, но точных данных об исключительной принадлежности к какому-то одному слою нет — имя «Мухтахутдин» давали и простым людям, подчёркивая их благочестие.

С точки зрения словообразования фамилия интересна тем, что сохранила стяжённую форму: полный вариант «Мухтарутдинов» или «Мухтардинов» встречается реже, а «Мухтахутдинов» — результат живого произношения, где звуки слились. В ономастических справочниках, например в работах по татарским фамилиям, подобные формы рассматриваются как показатель длительной бытовой адаптации арабского имени в тюркской среде.