Фамилия Мухубулин — редкий случай, когда основа почти наверняка восходит к арабскому имени, а не к русскому прозвищу или профессии. В её основе лежит арабское имя Мухаббат (محبة), что означает «любовь», «привязанность». Однако в русской записи фамилии произошёл характерный фонетический сдвиг: «а» перешла в «у», и имя стало звучать как «Мухубул» или «Мухуббул». Такая замена гласных — обычное дело при устной передаче нерусских имён в крестьянской среде, где письменная фиксация часто отставала от произношения.

Суффикс -ин указывает на стандартную русскую модель образования фамилий от имён, оканчивающихся на согласный или «-а/-я»: Мухубул → Мухубулин, то есть «сын Мухубула». Если бы основа оканчивалась на «-ов», логика была бы иной, но «-ин» здесь подчёркивает, что имя-основа воспринималось как «своё», а не как фамилия на тюркский манер.

Регионально фамилия тяготеет к Поволжью и Приуралью — территориям, где веками жили татары, башкиры и другие тюрко-мусульманские народы, активно заимствовавшие арабскую антропонимику. Встречается она и у русских, но в таких случаях, скорее всего, предок был крещёным татарином или башкиром, получившим фамилию по отцу-мусульманину. В советских паспортных столах «Мухубулин» могло записаться и как «Мухуббулин» — с двойной «б», что ближе к арабскому написанию, но оба варианта редки.

Версия о происхождении от тюркского слова «мухуб» (любимый) с тем же корнем тоже возможна, но менее вероятна: в фамилиях редко сохраняется чистое прилагательное без имени-носителя. Так что ваш предок, скорее всего, носил имя Мухаббат/Мухубул, а фамилия просто закрепила, чей он сын. Известных носителей с такой фамилией в публичном поле нет — это один из тех случаев, когда фамилия осталась в узком кругу семей, не попав в справочники.