Фамилия Мулдуянова — яркий пример фамилии, образованной от прозвища, в основе которого лежит тюркское слово «мулда». В большинстве тюркских языков «мулда» (варианты: молда, мулла) означает «знаток», «учёный», «священнослужитель», «учитель». Изначально так называли грамотных людей, знающих арабскую письменность и религиозные тексты, — уважаемых членов общины, выполнявших функции духовного наставника и судьи. Прозвище Мулда (или Мулдуян) давали человеку, который либо сам был муллой, либо, по иронии, отличался набожностью или, наоборот, чрезмерным желанием поучать.

Разбор фамилии по составу показывает её региональную специфику. Основа «Мулдуян» — это форма, характерная для башкирского и татарского языков, где суффикс «-ян» (или «-йан») может указывать на принадлежность, подобно русскому «-ов» (буквально: «из рода Мулды»). Далее идёт русский патронимический суффикс «-ов-», адаптировавший тюркскую основу под стандарты русской фамильной системы, и окончание «-а», указывающее на женский вариант фамилии. Мужской вариант — Мулдуянов.

Географически фамилия тяготеет к Южному Уралу и Зауралью. Наибольшая концентрация носителей фиксируется в Башкортостане, Челябинской и Оренбургской областях, а также в соседних регионах, где исторически жили башкиры и татары. Это типичная фамилия для исламизированных тюркских народов, где имена и прозвища религиозного характера были распространены повсеместно.

В отличие от более частых фамилий вроде Муллин или Муллаев, форма Мулдуянова встречается реже. Она сохранила архаичный диалектный вариант основы, который в современном башкирском языке мог звучать как «молдо» или «молдай». Таким образом, фамилия — не просто указание на профессию предка, а свидетельство его высокого социального статуса в общине, где грамотность и знание Корана ценились на вес золота.