Фамилия Мунинкина — редкая и не сразу «читаемая». Первое, что бросается в глаза: суффикс -ин, который указывает на принадлежность. В русской модели фамилия Мунинкин (а Мунинкина — её женская форма) образована от прозвища или имени, которое оканчивалось на -а или -я, и отвечает на вопрос «чей?»: «сын Мунинки» или «человек из семьи Мунинкиных».

Основа — «Мунинк-». Здесь мы видим уменьшительно-ласкательный суффикс -к-, характерный для прозвищ и некалендарных имён в северных и центральных говорах России. Корень, скорее всего, «мун-». Самая прямая версия: перед нами вариант от слова «муня» — в диалектах так называли вялого, медлительного или капризного человека (сравните с «мундить» — ныть, тянуть). В ономастике это попадает в ряд фамилий, образованных от прозвищ по характеру: Мямлин, Нытиков, Квелый.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых говорах «муня» означало «непонятно бормочущий», от звукоподражательного «му-му». Но в отличие от фамилии Мунин, где корень мог быть и от канонического имени (например, от Мун — сокращение от Эммануил), в фамилии Мунинкин уменьшительная форма указывает именно на прозвище, а не на крестильное имя. Церковные имена редко давали такие «двойные» уменьшительные суффиксы.

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку европейской России. Встречается в старых переписях Вятской губернии и в Зауралье — там, где прозвищные фамилии на -ин и -кин особенно часты. Сословно носители, скорее всего, были государственными крестьянами или однодворцами: дворянские фамилии такой модели почти не образуют.

Таким образом, предок носительницы фамилии Мунинкина — человек, которого в деревне прозвали Мунинка, то есть «сын Муни» или просто «маленький Мунька». Прозвище было дано за характер: медлительный, нудный или неразговорчивый. Со временем это слово вышло из обихода, а фамилия осталась.