Фамилия Мурзаченко звучит на юге России и Украины, и её разбор стоит начать с суффикса. Модель на «-енко» — типичная для украинской и белорусской ономастики, она указывает на происхождение от прозвища или имени отца. В данном случае основа «Мурзак» или, реже, «Мурзач» — это уменьшительная форма от слова «мурза».

Слово «мурза» пришло из тюркских языков (от персидского «мирза» — «сын эмира», «княжич») и в русских землях означало татарского князя, знатного человека, а также могло быть личным именем. Однако фамилия Мурзаченко — не княжеская. В XVI–XVII веках «мурзой» на Руси могли прозвать любого смуглого, черноглазого или просто сурового человека, либо того, кто служил у татарского мурзы. Уменьшительный суффикс «-ак» (Мурзак) в прозвище часто придавал оттенок фамильярности или указывал на человека с ярко выраженной чертой: «Мурзак» — тот, кто похож на мурзу, либо сын мурзы.

Таким образом, Мурзаченко — это «сын Мурзака». Первый носитель фамилии, скорее всего, был потомком человека по прозвищу Мурзак, которое дали за внешнее сходство или за службу. Географически фамилия чаще встречается в чернозёмных областях России (Белгородская, Воронежская области) и на востоке Украины — в зоне активных контактов славянского и тюркского населения. В отличие от фамилий на «-ов» (Мурзаков), форма на «-енко» закрепилась в среде казачества и крестьянства, где была распространена патронимическая модель именования. Прямого отношения к дворянству эта фамилия не имеет, хотя её основа и звучит аристократично.