Фамилия Мурзайкина образована от прозвища Мурзайка, а то, в свою очередь, восходит к тюркскому слову «мурза». Так на Руси называли знатных людей татарского происхождения, а само слово переводится как «принц» или «князь». Уменьшительный суффикс -ка в прозвище указывает на то, что Мурзайкой, скорее всего, называли сына мурзы — молодого наследника знатного рода. Потомки этого человека и получили фамилию Мурзайкина.

Это типичная модель для древнейших восточных фамилий, которые укоренились в русской среде после присоединения Казанского и Астраханского ханств. Служилые татары переходили на русскую службу, крестились, и их потомки уже носили фамилии, образованные по русской словообразовательной модели: к основе прозвища добавлялся суффикс -ин, указывающий на принадлежность к роду. Мурзайкин — «чей?» — сын или внук Мурзайки.

Интересно, что фамилия сохранила не только тюркский корень, но и редкий уменьшительный формант. Если бы предка звали просто Мурза, мы бы имели фамилию Мурзин, которая встречается гораздо чаще. Форма Мурзайкина говорит о том, что в основе лежало именно ласкательное, семейное именование — так мальчика могли звать дома, а прозвище закрепилось за ним и перешло к детям.

Встречается и мужской вариант — Мурзайкин. В женском роде фамилия склоняется по обычным правилам. Географически фамилия распространена в Поволжье и на Урале, где исторически было сильное татарское влияние, хотя сегодня её носители живут по всей России.