Фамилия Мусипова звучит на слух скорее как русская, но её корни уходят в тюркскую или арабо-мусульманскую среду. В основе, скорее всего, лежит имя Мусип — один из вариантов арабского имени Юсуф (Иосиф), который через татарское или башкирское посредничество приобрёл форму с начальным «М». В тюркских языках звук «й» в начале слова часто переходит в «м» (сравните: Юсуф — Мусип), так что этимология прозрачна: фамилия буквально означает «потомок (или принадлежащий) Мусипа».

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую модель образования фамилий по отчеству, но сама фамилия почти наверняка имеет невеликорусское происхождение. Она характерна для татар, башкир, казахов и других народов, у которых в XIX–XX веках активно закреплялись русифицированные фамилии на -ов/-ев. Поскольку имя Мусип встречается в исламской традиции, предки носительницы фамилии были, вероятно, мусульманами, а сама фамилия могла появиться в метрических книгах или при переписи населения, когда крестьянам или горожанам давали фамилию по имени отца.

Географически фамилия Мусипова распространена в Поволжье (Татарстан, Башкортостан), а также в Казахстане и Средней Азии. Встречается и у русских, но в таком случае это, скорее, результат межэтнических браков или усвоения фамилии через крещение — хотя имя Мусип не было каноническим в православных святцах. Мужской вариант фамилии — Мусипов.

Если говорить о социальном контексте, то носители фамилии в XIX веке могли быть как крестьянами, так и ремесленниками или купцами — имя Мусип не указывает на знатное происхождение. В советское время фамилия не подверглась переделке, так как её звучание легко вписалось в русскую грамматику. Сегодня это редкая, но живая фамилия, которая несёт в себе следы многовекового культурного обмена между тюркским и славянским миром.