Основой фамилии Мусияченко послужило мирское имя Муся. Фамилия Мусияченко украинского происхождения, на что указывает суффикс -ЕНКО. В ее основе лежит имя Муся, уменьшительная форма имен Мария, Моисей. Возможно, что фамилия образована и от татарского имени Муса (в переводе с древнеегипетского «дитя»). Не исключено, что фамилия была образована и от диалектного «мусак», «мусат». Если придерживаться этой версии, то можно предположить, что предок обладателя данной фамилии, скорее всего, был путешественником или паломником, странствовавшим по городам и весям. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Муся, со временем получил фамилию Мусияченко.