Фамилия Муспахов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить случайные и маловероятные версии (вроде связи с мифическим «Мус-пахом»), то наиболее правдоподобное объяснение лежит в тюркской ономастике. Основа «Мус-» может восходить к мужскому имени Муса (библейский Моисей в исламской традиции), а суффикс «-пах» или «-бах» — это искажённый или диалектный вариант тюркского «бек» (господин, князь). Таким образом, Муспах — это «Муса-бек», то есть «господин Муса» или «князь Муса».

Словообразовательная модель здесь нестандартна. Фамилия образована с помощью русского патронимического суффикса «-ов», но исходная форма «Муспах» — это сложное имя, где вторая часть «-пах» постепенно утратила первоначальный смысл и стала восприниматься как часть личного имени. В тюркских языках (особенно в кумыкском, ногайском, карачаево-балкарском) такие сращения встречаются: имя + титул сливались в одно слово, которое затем русифицировали, добавив окончание.

Географически фамилия тяготеет к Северному Кавказу и Нижнему Поволжью. Встречается среди кумыков и ногайцев, где имя Муса было распространено, а титул «бек» (в форме «пах») указывал на принадлежность к знатному или уважаемому роду. В дореволюционных записях могли фиксировать варианты «Мусубеков» или «Мусабеков», но «Муспахов» — это более просторечная, «стяжённая» форма, которая закрепилась в документах.

Есть и более прозаичная версия: фамилия могла возникнуть от прозвища «Муспах» — человека, который постоянно что-то муспахает (от диалектного глагола со значением «месить», «пачкать», «делать небрежно»). Однако эта гипотеза слабее: подобные прозвища обычно давали не по действию, а по характерному звуку или результату, и они редко превращались в фамилии с таким «книжным» суффиксом, как «-ов». Тюркское происхождение выглядит убедительнее.

Носители фамилии Муспахов — это, скорее всего, потомки тюркских мусульман, у которых имя Муса сочеталось с социальным статусом. В советское время фамилия почти не встречалась за пределами национальных республик, что подтверждает её локальный характер.