Фамилия Мусыркин — одна из тех, что ставит перед исследователем сразу несколько загадок. Её основа, «Мусырк-», неочевидна, а суффикс «-ин» указывает на типичную модель русских фамилий, образованных от личного прозвища или имени, оканчивающегося на -а/-я. В данном случае исходным было, скорее всего, прозвище Мусырка.

Корень «мусыр-» можно связать с диалектным словом «мусырить» или «мусыркать». В некоторых говорах русского севера и Сибири так называли человека, который делает что-то медленно, вяло, «мусолит» или возится без толку. Другая версия отсылает к тюркским языкам, где «мусыр» (или «мысыр») — искажённое «Египет», но такое прозвище для русского крестьянина маловероятно и выглядит натяжкой. Гораздо правдоподобнее, что в основе лежит местное, бытовое слово, обозначавшее нерасторопного или неряшливого человека.

Суффикс «-ин» говорит о том, что фамилия закрепилась в среде, где прозвища на -а были обычны. Это характерно для северных и центральных областей России, а также для Сибири, куда переселенцы приносили свои говоры. Фамилия Мусыркин — довольно редкая, её носители встречаются в основном в Пермском крае, Кировской области и на Урале. Это указывает на то, что род мог происходить из среды государственных или заводских крестьян, которые осваивали эти земли в XVIII–XIX веках.

Сравнение с однокоренными фамилиями, такими как Мусырев, Мусырёв, показывает, что основа «мусыр-» не была широко распространена, но устойчиво давала прозвища в определённых локальных группах. Социальный статус предков Мусыркиных, скорее всего, был крестьянским или мещанским — фамилия не несёт признаков дворянского или духовного происхождения (отсутствие «-ский» и характерной книжной основы). Таким образом, Мусыркин — это фамилия-прозвище, закрепившая за потомками память о не самом лестном, но живом слове из речи их предков.