Фамилия Мутитхин — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а звукоподражание или междометие. В русском языке существует пласт фамилий, образованных от глагольных форм или возгласов, и Мутитхин — одна из них. Её ядро — «мутитх», что с большой вероятностью восходит к глаголу «мутить» (в значении «делать мутным, взбалтывать, ссорить»), осложнённому экспрессивным суффиксом или частицей «-тх-». В диалектах и просторечии форма «мутитха» могла означать человека, который постоянно вносит смуту, сплетничает или, наоборот, суетится, «мутит воду». Суффикс «-тх-» встречается в прозвищах, образованных от глаголов, и придаёт им оттенок действия или привычки (сравните с фамилиями Бурчалкин, Крикухин, где основа — глагол плюс «-к-» или «-х-»). Аффикс «-ин» — стандартный русский патронимический суффикс, отвечающий на вопрос «чей?»: «сын Мутитхи». Таким образом, фамилия означает «потомок человека по прозвищу Мутитха». Географически фамилия почти не встречается, что говорит о её позднем и узколокальном происхождении, вероятно, в среде крестьян или посадских людей, где прозвища могли быть яркими и неожиданными. Никакой связи с тюркскими или финно-угорскими корнями нет — это чисто русская словообразовательная модель, построенная на глагольной основе и эмоциональном суффиксе.