Фамилия Мярин — редкий случай, где суффикс -ин не указывает на принадлежность отцу или матери, а скорее маскирует исходное прозвище. В русской модели -ин обычно крепится к основе на -а/-я (сын Гаврилы — Гаврилин, сын Мызы — Мызин). Но Мярин явно не от имени Мяря — такого крестильного имени не было. Значит, корень лежит в прозвище или географическом названии.

Самая прямая версия: основа «мяр» восходит к диалектному глаголу «мярить» — мерить, отмерять. В северных и сибирских говорах «мяра» — это мера, единица измерения. Прозвище Мяра могли дать человеку, который отвечал за меры веса или длины, например, целовальнику при казённой палате или торговцу, строго отмерявшему товар. В этом случае Мярин — «из рода Мяры». Суффикс -ин здесь работает как притяжательный, но по отношению к прозвищу, а не к имени.

Вторая версия — топонимическая. В Архангельской области есть река Мяра, а в Карелии — деревня Мярино (сейчас нежилая, но в метрических книгах XIX века встречается). Переселенец из тех мест мог получить фамилию по названию реки или села. На Русском Севере фамилии на -ин от географических названий обычны (Важен — Важин, Онега — Онегин). Мярин мог быть «выходцем с Мяры».

Не стоит искать в фамилии финно-угорский корень «мяр» (в вепсском — «ягода»), хотя территориально это возможно. Фонетически фамилия звучит как исконно русская, и её носители — в основном из центральных областей России (по данным современных телефонных справочников — Тверская, Ярославская, Московская области). Это скорее подтверждает прозвищную версию, чем северную миграцию.

В сословном отношении Мярины, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. В дворянские родословные книги эта фамилия не попала — ни в гербовники, ни в списки служилых людей она не входит.