Фамилия Мынаковский образована от личного прозвища и относится к распространенному типу славянских фамилий. Фамилия Мынаковский, вероятно, является фонетическим вариантом фамилии Минаковский. Она образована от прозвища Минак, в основе которого лежит диалектный глагол «минать», то есть «мять». Возможно, это прозвище было связано с родом занятий человека: например, он мог заниматься выделкой кож. Согласно другой версии, фамилия Минаковский происходит от имени Минай, в котором смешаны производные от двух канонических мужских личных имен – Мина и Миней. Стоит отметить, что Мина и Минай нередко употреблялись в качестве прозвищ. Характерный суффикс -ский указывает на возможное украинское, белорусское или польское происхождение фамилии Мынаковский. О точном месте и времени возникновения фамилии Мынаковский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Мынаковский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.