Фамилия Мынгишбаева принадлежит к пласту восточных, точнее тюркских, фамилий, которые хранят память о доисламских и раннемусульманских именах-пожеланиях. Она образована от мужского личного имени Мынгишбай, и, хотя на слух она кажется сложной, её структура прозрачна и делится на две смысловые части.

Первая часть — Мынгиш. Здесь исследователи видят диалектный вариант старинного татарского имени Мангуш. Значение этого имени уходит корнями в пожелание новорождённому: «вечный друг» или, что ближе к бытовой трактовке, «мальчик, который будет жить очень долго». Вторая часть — Бай, один из самых частотных компонентов тюркских имён, который означал «хозяин», «господин», «богатый и могущественный человек». Соединив эти два корня, родители, нарекавшие сына Мынгишбаем, вкладывали в имя целую программу жизни: долголетие, крепкую дружбу и материальную состоятельность.

Словообразовательная модель здесь классическая для тюркских фамилий, адаптированных в русской среде. К основе Мынгишбай добавили русский патронимический суффикс -ев, который указывает на принадлежность к роду: потомок человека по имени Мынгишбай стал Мынгишбаевым, а женщина из этого рода — Мынгишбаевой. Такой способ формирования фамилий был массовым в XIX — начале XX века, когда оседлое население Поволжья, Приуралья и Средней Азии получало официальные документы, где имя отца переходило в фамилию детей.

Стоит отметить, что фамилия Мынгишбаева несёт в себе и географический отпечаток. Подобные составные имена с компонентом -бай чаще всего встречались у башкир, татар, казахов и народов Средней Азии. В каждом из этих языков имя Мангуш могло звучать чуть иначе, но смысл — пожелание долгой жизни — сохранялся. Поэтому носительница фамилии может с равной вероятностью иметь корни в любой из этих культур, и точную этническую принадлежность предков без генеалогического исследования установить сложно.

В отличие от многих русских фамилий, образованных от прозвищ или профессий, Мынгишбаева — это чисто именная фамилия. Она не говорит о ремесле или социальном статусе предка, но зато точно передаёт то, чего желали ребёнку в день его рождения. Это делает её не просто маркером рода, а коротким посланием из прошлого, где имя служило оберегом и благословением.