Фамилия Мышевода — одна из тех, что заставляет задуматься: это прозвище, профессия или случайное созвучие? Скорее всего, перед нами прозвищная фамилия, образованная от двух корней: «мышь» и «водить». Суффикс -а в конце указывает на древнерусскую модель прозвищ, обозначающих человека по действию или занятию (ср. Воевода, Гуляйда, Непейвода). То есть Мышевода — это тот, кто «водит мышей».

Самая правдоподобная версия — ироничное прозвище кота или кошколова. В крестьянской среде кошек ценили за ловлю мышей, и хозяина особенно удачливого кота могли в шутку назвать Мышеводой. Вторая версия — прозвище человека, который занимался отловом или травлей грызунов, что в доиндустриальной деревне было делом нужным: мыши портили зерно в амбарах и избы. Третья, менее вероятная, — переосмысление какого-то диалектного слова, например, «мышь» могло означать нечто мелкое и юркое, а «водить» — обманывать или хитрить. Тогда Мышевода — ловкий плут.

Фамилия очень редкая. Она не встречается в списках дворянских родов и в массовых крестьянских переписях XIX века, что говорит о её локальном бытовании, возможно, на севере или в центральных губерниях, где сохранялись архаичные прозвищные формы. По модели образования она схожа с фамилиями Воеводин (от Воевода), Козловодов, Свинопас, но отличается тем, что в основе лежит не хозяйственно-полезное животное, а вредитель, что подчёркивает шутливый или презрительный оттенок прозвища.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные двухосновные прозвища на -а рассматриваются как характерные для допетровской эпохи. Мышевода — живой след той языковой игры, когда человека называли не по отцу или ремеслу, а по его связи с миром зверей, часто гротескной. Носителям фамилии стоит помнить: их предок, скорее всего, был человеком с чувством юмора или острым на язык окружением, а не мышиным пастухом в буквальном смысле.