Фамилия Наабер — редкий пример фамилии, которая почти наверняка не русская по происхождению, а прибалтийско-немецкая или эстонская. В России и странах бывшего СССР она встречается единично, и её носители — потомки остзейских немцев или эстонцев, переселившихся в имперские времена.

Разбираем словообразование. Основа «Нааб-» может восходить к нижненемецкому или эстонскому корню. В немецком языке Naab — это название реки в Баварии (приток Дуная), но для фамилии более вероятна связь с эстонским naaber, что означает «сосед». В эстонском языке слово заимствовано из немецкого Nachbar («сосед»). Таким образом, фамилия Наабер — это указание на место жительства или социальную роль: предок был «соседом» по отношению к кому-то, либо жил рядом с заметным объектом.

Суффикса -ов/-ев или -ин в фамилии нет, что характерно для неславянских ономастических моделей. Окончание -ер — типичный немецкий суффикс деятеля или жителя (например, Bäcker — пекарь, Berliner — берлинец). В эстонском варианте слово осталось без изменений, так как эстонцы часто брали фамилии из бытовой лексики без дополнительных аффиксов.

Географически фамилия Наабер привязана к Эстонии и северной Латвии (историческая Лифляндия). В метрических книгах лютеранских приходов XIX века можно найти крестьян и горожан с этой фамилией в уездах Вирумаа и Харьюмаа. В России фамилия могла появиться после отмены крепостного права в Прибалтике (1816–1819), когда эстонцам начали массово давать постоянные фамилии.

Если ваши предки носили фамилию Наабер, скорее всего, они были эстонскими крестьянами, ремесленниками или мелкими торговцами. Дворянской ветви не зафиксировано — фамилия слишком «прозрачна» по значению, чтобы стать аристократической. В советское время носители фамилии могли русифицировать написание, заменив двойное «а» на одинарное или добавив окончание -ов, но оригинальная форма сохранилась у тех, кто остался в Эстонии.