Фамилия Набиджанова образована от мужского имени Набиджан, которое распространено в среде народов Средней Азии и Кавказа, исповедующих ислам. Это составное имя: первая часть «Наби» восходит к арабскому слову «наби» — «пророк», а вторая часть «джан» — иранского происхождения, означает «душа» или «дорогой, любимый». Таким образом, имя Набиджан можно перевести как «душа пророка» или «дорогой, как пророк». Фамилия, соответственно, означает «потомок (или принадлежащий) Набиджана».

Суффикс -ов- (в форме женского рода -ова) — типичный для русской фамильной модели, которая закрепилась в документах при русификации фамилий нерусских народов. В данном случае фамилия образована не от прозвища или профессии, а от личного имени отца, что характерно для патронимических фамилий. В исходной, нерусифицированной форме в таджикском или узбекском языках фамилия могла бы звучать как Набиджанов (или Набиджанзода), но через русское делопроизводство получила стандартное окончание -ов.

Географически фамилия Набиджанова чаще всего встречается в Таджикистане, Узбекистане, а также среди таджикской и узбекской диаспоры в России. Встречаемость фамилии относительно невысокая, что говорит о её локальном происхождении: скорее всего, родоначальник был известным или уважаемым человеком в своей общине, и его имя закрепилось как родовое. Попытки связать фамилию с арабскими корнями напрямую (например, с «набиг» — «гениальный») ошибочны: в основе лежит именно имя Набиджан, а не нарицательное слово.

Таким образом, носительница фамилии Набиджанова может считать, что её предки по мужской линии происходят из семьи, где отца звали Набиджан. Фамилия не указывает на конкретное ремесло или сословие, но подчёркивает религиозный (исламский) и культурный контекст — имя, данное в честь пророка, было особенно почитаемым.