Фамилия Налпенко — редкий случай, когда основа не бросается в глаза и не прочитывается сразу. На слух она кажется то ли украинской, то ли белорусской, и это верное направление. Суффикс -енко (с ударением, как правило, на последний слог) — один из самых распространённых фамильных формантов на востоке Украины и в южных областях Беларуси. Он указывает на происхождение от отца: Налпенко — буквально «сын (или потомок) Налпы».

Сложность в том, что прозвище Налпа в современных словарях русского и украинского языков не зафиксировано. Скорее всего, это диалектное или профессиональное слово, которое вышло из обихода. Можно предположить, что в его основе лежит глагол «налопаться» (наесться досыта, нахлебаться) или «налпать» — в некоторых говорах так говорили о неуклюжем, неповоротливом человеке. В этом случае Налпенко — фамилия, образованная от прозвища, которое дали за особенность поведения или внешности: медлительного, тяжеловесного или, наоборот, ненасытного едока.

Версия с польским влиянием тоже имеет право на существование. В польском языке есть слово «nalepa» — так называли лепёшку, пресный хлеб, а также человека, который любит лакомиться, привереду. Если предки носителя фамилии жили на западноукраинских землях, где было сильное польское влияние, прозвище Налпа могло означать «сладкоежка» или «тот, кто печёт лепёшки». В этом случае фамилия относилась бы к числу «хлебных» — по роду занятий или кулинарным пристрастиям.

Географически фамилия Налпенко встречается крайне редко. Основные очаги — Полтавская и Сумская области Украины, а также единичные записи в южнорусских областях, куда переселялись украинские крестьяне в XIX веке. Сословного барьера у фамилии не было: с суффиксом -енко её могли носить и казаки, и крестьяне, и мещане.

В написании фамилии возможна вариация с одной «п» — Напенко, но это уже совсем другая история, связанная с именем Нап (сокращённое от Ионафан или греческого Напа). Налпенко с буквой «л» — более архаичный и диалектный вариант, который сохранил в себе звучание того самого прозвища, что дали предку за его характер или ремесло.