Фамилия Насакаев — редкий случай, когда основа, скорее всего, не русская, а тюркская, но оформление фамилии — типично русское. Модель образования проста: корень «Насакай» плюс суффикс принадлежности «-ев». В русской традиции этот суффикс добавляли к основам, оканчивающимся на согласный или «й», чтобы превратить прозвище или имя в фамилию, отвечающую на вопрос «чей?» — то есть «сын Насакая» или «человек из рода Насакая».

Самая вероятная версия происхождения корня — от тюркского мужского имени Насакай. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) имя могло образоваться от корня «нас» (род, происхождение) с уменьшительно-ласкательным аффиксом «-кай». Буквально — «родовитый», «знатного происхождения». Или же в основе лежит диалектное слово «насака» — так в некоторых тюркских говорах называли подарок, гостинец, что могло стать прозвищем щедрого человека.

Фамилия географически привязана к регионам, где исторически смешивались русское и тюркское население. Чаще всего она встречается в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане. Это указывает на то, что предки носителя фамилии могли быть крещёными татарами, башкирами или казаками, перенявшими русскую фамильную модель.

В отличие от фамилий с продуктивными славянскими суффиксами («-ов» от «-ович»), здесь мы видим прямое заимствование личного имени без промежуточных прозвищ. Это говорит о том, что фамилия сформировалась сравнительно поздно, в XVIII–XIX веках, когда фиксация фамилий у нерусских народов шла по упрощённой схеме: брали имя отца и добавляли русский суффикс.

Сословно предки Насакаевых скорее всего относились к государственным крестьянам или казачеству — в дворянских родословных книгах эта фамилия не зафиксирована. Основные занятия: земледелие, скотоводство, а в казачьей среде — пограничная служба.