Фамилия Насуто — редкая и неочевидная для русского уха. Чтобы понять её происхождение, нужно сразу отказаться от привычной славянской модели с суффиксами -ов/-ев или -ин. В фамилии нет ни одного из этих формантов, а значит, перед нами, скорее всего, не крестьянская или дворянская фамилия центральной России, образованная от имени или прозвища по отцу. Насуто — это либо позднее искусственное образование, либо фамилия, пришедшая из другого языка.

Самая вероятная версия — японское происхождение. В японском языке фамилия Насуто (那須斗 или 納素斗) существует и состоит из двух иероглифов. Первый часто обозначает местность (например, Насу — регион в префектуре Тотиги), второй может означать «ковш», «созвездие» или быть просто благозвучным окончанием. В этом случае фамилия указывает на географическую привязку предка — выходца из местности Насу, или на род занятий, связанный с мерой сыпучих тел (если иероглиф «то» означал меру объёма). Для Японии такие фамилии типичны, и носители Насуто встречаются там, хоть и не входят в сотню самых распространённых.

Менее вероятная, но не исключённая версия — фамилия могла возникнуть как русифицированная форма финно-угорского или прибалтийского прозвища. В карельском или вепсском языке «nasu» означает «свинья», «боров». Суффикс -то мог быть остатком топонимического окончания (как в названиях деревень типа Кукас-Наволок). Тогда предок получил прозвище Насуто за внешность, характер или занятие (свинопас), а при переписи это прозвище записали как фамилию без изменений. Однако в русской традиции такие прозвища обычно получали суффикс -ов (Насутов), поэтому форма без суффикса — аргумент в пользу иноязычного заимствования.

Если отбросить экзотику, остаётся третий, самый прагматичный вариант: фамилия могла быть изменена при записи. В дореволюционных документах встречаются случаи, когда писарь, не расслышав или не поняв фамилию переселенца (например, польскую Насута, белорусскую Насуто́вич или украинскую Насу́тенко), записывал её на слух как Насуто. Такие «усечённые» фамилии встречаются в южных и западных губерниях Российской империи, где жили носители польского, белорусского или украинского языков.

В любом случае, фамилия Насуто — не массовая. Её носители в России, скорее всего, немногочисленны и могут быть потомками японских переселенцев начала XX века, обрусевших финно-угров или людей, чья фамилия была упрощена при переезде. Точный ответ даст только генеалогическое исследование с опорой на метрические книги конкретной местности.