Фамилия Натыкин — наглядный пример того, как русская модель фамилии на -ин работает с основой, которая не сразу поддаётся толкованию. На первый взгляд она похожа на отчество от имени Натыка или прозвища Натыка, но в реальной антропонимии такое имя не встречается. Поэтому корень здесь, скорее всего, глагольный — «натыкать» (в значении «воткнуть, насадить» или «натолкнуть, наставить»).

В основе фамилии лежит прозвище Натыка. Так в старину могли назвать человека по двум сценариям. Первый — бытовой: натыкальщик, тот, кто насаживает что-то на что-то (например, нанизывает рыбу на кукан или насаживает топор на топорище). Второй — переносный, более распространённый в диалектах: «натыка» — человек, который постоянно натыкается на что-то, неловкий или, наоборот, назойливый, «лезущий» в дела. В некоторых говорах слово «натыка» означало ещё и «указчик», «наставник» — от глагола «натыкать» в смысле «указывать, тыкать пальцем». Прозвище могло закрепиться за деятельным, навязчивым или просто суетливым человеком.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Натыкин — буквально «сын Натыки». Это типичная патронимическая модель для фамилий, образованных от основ на -а, -я. В центральных и северных губерниях России такие фамилии преобладают, и Натыкин — не исключение. Географически фамилия редкая, встречается в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает её диалектное происхождение: в этих регионах слово «натыка» бытовало в значении «задира» или «непоседа».

Интересно, что фамилия Натыкин стоит в одном ряду с однокоренными Тыкин, Натыкалов, Натыкач. Но, в отличие от них, форма на -ин оказалась самой устойчивой и «обрусевшей». Никакого отношения к тюркским или финно-угорским корням здесь нет — это чисто славянская модель, где прозвище от действия стало родоначальником фамилии.