Фамилия Наушабаева — женская форма фамилии Наушабаев, которая образована по тюркской модели с компонентом «бай». В переводе с казахского, башкирского, татарского и других тюркских языков «бай» означает «господин», «богач», «хозяин», а в прошлом — состоятельный, уважаемый человек. Первая часть фамилии — «Науша» — скорее всего, восходит к личному имени Науша (варианты: Науша, Науш), которое в свою очередь могло быть производным от арабского имени Нух (библейский Ной) или от тюркского слова «науша» — «сладкий», «вкусный» (в переносном смысле — «приятный», «милый»). Таким образом, исходное прозвище или имя Наушабай означало «богатый (или господин) по имени Науша» либо «сладкий (приятный) бай».

Фамилия характерна для народов Средней Азии и Казахстана, особенно распространена среди казахов. Суффикс «-ев/-а» в русской передаче указывает на принадлежность (чьих? — Наушабаевых), что типично для русификации тюркских фамилий в XIX–XX веках. В оригинале фамилия звучала бы как Наушабайұлы (для мужчины) и Наушабайқызы (для женщины), но при записи в документах Российской империи и СССР закрепилась форма с русским окончанием.

Интересная деталь: фамилия Наушабаева нечасто встречается за пределами Казахстана и приграничных регионов России. Это говорит о том, что род, скорее всего, не мигрировал далеко от места своего возникновения. Предки носителей фамилии могли быть скотоводами или мелкими землевладельцами — «баями» в ауле, то есть людьми, обладавшими достатком и влиянием в своей общине. В советское время фамилия утратила сословный оттенок, но сохранила память о статусе основателя рода.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Наушаев, Наушанов, Наушабай), то вариант Наушабаева — один из самых прозрачных по значению: он прямо указывает на имя и социальное положение предка. Другие формы могли возникнуть из-за ошибок писцов или местных диалектных произношений.